| 15. Jornada | 16.01.2000 | AEK Athen | - | AO Kavala | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 23.01.2000 | AO Trikala | - | AEK Athen | 0:1 |  |
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| 17. Jornada | 31.01.2000 | PS Kalamata | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 05.02.2000 | AEK Athen | - | PAOK Saloniki | 2:0 | |
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| 19. Jornada | 13.02.2000 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 1:0 | |
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| 21. Jornada | 27.02.2000 | Iraklis Saloniki | - | AEK Athen | 3:1 | |
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| 22. Jornada | 05.03.2000 | AEK Athen | - | Paniliakos Pyrgos | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 25.03.2000 | Aris Saloniki | - | AEK Athen | 1:1 | |
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| 26. Jornada | 01.04.2000 | OFI Heraklion | - | AEK Athen | 1:2 | |
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| 29. Jornada | 23.04.2000 | AEK Athen | - | AO Proodeftiki | 3:2 | ||||
| 30. Jornada | 03.05.2000 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 0:2 | ||||
| 32. Jornada | 14.05.2000 | AO Kavala | - | AEK Athen | 0:2 |
Grecia