| 19. Jornada | 29.02.2000 | NK Zagreb | - | NK Varteks | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 04.03.2000 | NK Varteks | - | Slaven Belupo | 0:1 | ||||
| 21. Jornada | 07.03.2000 | NK Osijek | - | NK Varteks | 1:1 |  |
|||
| 22. Jornada | 11.03.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 0:0 |  |
|||
| 23. Jornada | 18.03.2000 | Croatia Zagreb | - | NK Varteks | 0:1 | ||||
| 27. Jornada | 11.04.2000 | NK Varteks | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | |
|||
| 28. Jornada | 15.04.2000 | HNK Rijeka | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 29. Jornada | 24.04.2000 | NK Varteks | - | NK Vukovar 91 | 3:2 | |
|||
| 30. Jornada | 29.04.2000 | NK Osijek | - | NK Varteks | 0:0 | |
|||
| 31. Jornada | 06.05.2000 | NK Varteks | - | NK Istra Pula | 1:2 | |
|
||
| 33. Jornada | 13.05.2000 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 1:1 |
Croacia