| 7. Jornada | 23.10.2006 | Panathinaikos | - | AEK Athen | 1:2 | ||||
| 8. Jornada | 29.10.2006 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 0:1 |  |
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| 9. Jornada | 05.11.2006 | Panathinaikos | - | Olympiacos | 1:0 |  |
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| 10. Jornada | 12.11.2006 | Ergotelis | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 19.11.2006 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:4 | ||||
| 12. Jornada | 26.11.2006 | Panathinaikos | - | Apollon Kalamarias | 3:2 | ||||
| 13. Jornada | 03.12.2006 | Aris Saloniki | - | Panathinaikos | 1:0 | |
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| 14. Jornada | 09.12.2006 | Panathinaikos | - | AE Lárissa | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 17.12.2006 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 3:1 | |
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| 16. Jornada | 07.01.2007 | Panathinaikos | - | AO Egaleo | 1:0 | |
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| 18. Jornada | 20.01.2007 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 25.02.2007 | Panathinaikos | - | Iraklis Saloniki | 3:0 |
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