| 10. Jornada | 05.12.1999 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 23.12.1999 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:3 | ||||
| 21. Jornada | 28.02.2000 | PS Kalamata | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 12.03.2000 | Iraklis Saloniki | - | Panathinaikos | 1:3 | ||||
| 26. Jornada | 02.04.2000 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 5:0 | ||||
| 31. Jornada | 08.05.2000 | Panathinaikos | - | AO Proodeftiki | 3:1 |  |
|||
| 32. Jornada | 14.05.2000 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 0:4 | ||||
| 33. Jornada | 21.05.2000 | Panathinaikos | - | Apollon Smyrnis | 5:0 | ||||
| 34. Jornada | 28.05.2000 | AO Kavala | - | Panathinaikos | 1:4 | |
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