| 3. Jornada | 10.09.2016 | AO Kerkyra | - | Platanias Chanion | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 18.09.2016 | AO Kerkyra | - | AE Lárissa | 2:0 | ||||
| 5. Jornada | 25.09.2016 | Levadiakos | - | AO Kerkyra | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 01.10.2016 | AO Kerkyra | - | PAS Giannina | 0:1 | ||||
| 7. Jornada | 15.10.2016 | Panetolikos | - | AO Kerkyra | 4:0 | ||||
| 12. Jornada | 27.11.2016 | Olympiacos | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 13. Jornada | 03.12.2016 | AO Kerkyra | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 1. Jornada | 04.01.2017 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 29.01.2017 | Platanias Chanion | - | AO Kerkyra | 2:1 | ||||
| 11. Jornada | 01.02.2017 | AEP Iraklis FC | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 04.02.2017 | AE Lárissa | - | AO Kerkyra | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 12.02.2017 | AO Kerkyra | - | Levadiakos | 1:0 | ||||
| 21. Jornada | 18.02.2017 | PAS Giannina | - | AO Kerkyra | 1:0 |  |
|||
| 22. Jornada | 25.02.2017 | AO Kerkyra | - | Panetolikos | 0:0 | |
|||
| 23. Jornada | 05.03.2017 | Asteras Tripolis | - | AO Kerkyra | 1:2 | ||||
| 24. Jornada | 12.03.2017 | AO Kerkyra | - | Xanthi FC | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 18.03.2017 | Veria FC | - | AO Kerkyra | 4:0 |
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