| 6. Jornada | 26.02.2016 | Alianza Petrolera | - | Atlético Junior | 1:2 |  |
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| 7. Jornada | 28.02.2016 | Atlético Junior | - | Jaguares de Córdoba | 1:0 | |
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| 8. Jornada | 06.03.2016 | Águilas Doradas | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 9. Jornada | 14.03.2016 | Atlético Junior | - | Deportes Tolima | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 08.05.2016 | Atlético Junior | - | Deportivo Cali | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 15.05.2016 | Envigado FC | - | Atlético Junior | 1:1 |
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