| 3. Jornada | 21.08.2016 | FC Penafiel | - | Académica de Coimbra | 1:0 | ||||
| 19. Jornada | 19.12.2016 | Vitória Guimarães B | - | Académica de Coimbra | 2:1 |  |
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| 25. Jornada | 04.02.2017 | Portimonense SC | - | Académica de Coimbra | 0:0 |  |
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| 30. Jornada | 05.03.2017 | FC Vizela | - | Académica de Coimbra | 0:1 | ||||
| 31. Jornada | 11.03.2017 | Académica de Coimbra | - | AD Fafe | 0:0 | ||||
| 33. Jornada | 19.03.2017 | Académica de Coimbra | - | Académico de Viseu | 1:2 | ||||
| 32. Jornada | 26.03.2017 | Varzim SC | - | Académica de Coimbra | 0:2 | ||||
| 34. Jornada | 02.04.2017 | Gil Vicente | - | Académica de Coimbra | 1:0 | ||||
| 35. Jornada | 06.04.2017 | Académica de Coimbra | - | CD Aves | 0:0 |  |
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| 37. Jornada | 19.04.2017 | Académica de Coimbra | - | SC Freamunde | 2:2 |  |
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| 38. Jornada | 24.04.2017 | Sporting Braga B | - | Académica de Coimbra | 1:0 | ||||
| 39. Jornada | 30.04.2017 | Benfica B | - | Académica de Coimbra | 1:0 | |
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| 40. Jornada | 06.05.2017 | Académica de Coimbra | - | Vitória Guimarães B | 1:0 | ||||
| 41. Jornada | 14.05.2017 | Sporting CP B | - | Académica de Coimbra | 1:2 | |
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| 42. Jornada | 21.05.2017 | Académica de Coimbra | - | Oporto B | 2:1 |
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