| 3. Jornada | 06.04.2003 | Zenit | - | FK Rostov | 0:0 |  |
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| 4. Jornada | 11.04.2003 | FK Rostov | - | Uralan Elista | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 19.04.2003 | CSKA Moscú | - | FK Rostov | 0:1 | |
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| 9. Jornada | 17.05.2003 | FK Rostov | - | Saturn-REN TV | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 25.05.2003 | Lokomotiv Moskva | - | FK Rostov | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 31.05.2003 | Chernomorets Novorossisk | - | FK Rostov | 2:2 | ||||
| 12. Jornada | 11.06.2003 | FK Rostov | - | Dinamo Moskva | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 19.06.2003 | Rubin Kazan | - | FK Rostov | 5:0 | |
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| 14. Jornada | 23.06.2003 | FK Rostov | - | Spartak Moskva | 3:2 | ||||
| 16. Jornada | 12.07.2003 | FK Rostov | - | Rotor Volgograd (1929-2005) | 4:3 | ||||
| 22. Jornada | 24.08.2003 | FK Rostov | - | Chernomorets Novorossisk | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 30.08.2003 | Torpedo Metallurg Moskva | - | FK Rostov | 0:3 | ||||
| 24. Jornada | 13.09.2003 | FK Rostov | - | Krylia Sovetov | 2:1 |  |
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| 25. Jornada | 20.09.2003 | Spartak-Alania Vladikavkaz | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 27.09.2003 | FK Rostov | - | CSKA Moscú | 0:1 | |
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| 28. Jornada | 18.10.2003 | FK Rostov | - | Zenit | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 25.10.2003 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 4:1 | |
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| 30. Jornada | 01.11.2003 | FK Rostov | - | Torpedo Moskva | 0:0 | |
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