| 1. Jornada | 30.07.2006 | FK Teplice | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 3. Jornada | 13.08.2006 | Dynamo České Budějovice | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 4. Jornada | 20.08.2006 | 1. FC Brno | - | Slavia Praga | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 26.08.2006 | Slovan Liberec | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 11.09.2006 | 1. FC Brno | - | Baník Ostrava | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 17.09.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Brno | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 23.09.2006 | 1. FC Slovácko | - | 1. FC Brno | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 01.10.2006 | 1. FC Brno | - | FK SIAD Most | 1:1 | ||||
| 10. Jornada | 14.10.2006 | Viktoria Plzeň | - | 1. FC Brno | 1:1 |  |
|||
| 15. Jornada | 19.11.2006 | 1. FC Brno | - | FK Marila Příbram | 2:0 | ||||
| 16. Jornada | 25.11.2006 | Tescoma Zlín | - | 1. FC Brno | 3:0 |
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