| Primera etapa | 18.09.2008 | MŠK Žilina | - | Levski Sofia | 1:1 | ||||
| Primera etapa | 02.10.2008 | Levski Sofia | - | MŠK Žilina | 0:1 | ||||
| Grupo F | 23.10.2008 | MŠK Žilina | - | Hamburgo | 1:2 | ||||
| Grupo F | 06.11.2008 | AFC Ajax | - | MŠK Žilina | 1:0 | ||||
| Grupo F | 27.11.2008 | MŠK Žilina | - | Slavia Praga | 0:0 | ||||
| Grupo F | 04.12.2008 | Aston Villa | - | MŠK Žilina | 1:2 |
Eslovaquia