| 1. Jornada | 24.07.2009 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 2. Jornada | 02.08.2009 | NK Varteks | - | HNK Rijeka | 1:1 |  |
|||
| 3. Jornada | 08.08.2009 | NK Varteks | - | Lokomotiva Zagreb | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 15.08.2009 | NK Istra 1961 | - | NK Varteks | 0:1 | ||||
| 5. Jornada | 22.08.2009 | NK Varteks | - | NK Zagreb | 1:0 | ||||
| 6. Jornada | 29.08.2009 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 7. Jornada | 13.09.2009 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 0:3 | |
|||
| 8. Jornada | 19.09.2009 | HNK Šibenik | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 9. Jornada | 26.09.2009 | NK Varteks | - | NK Karlovac | 0:1 | |
|||
| 11. Jornada | 17.10.2009 | NK Varteks | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 24.10.2009 | NK Croatia Sesvete | - | NK Varteks | 2:2 | ||||
| 14. Jornada | 07.11.2009 | NK Zadar | - | NK Varteks | 2:0 |
Croacia