| 23. Jornada | 12.03.2006 | Yverdon Sport FC | - | FC Thun | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 18.03.2006 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 22.03.2006 | FC Thun | - | Grasshopper Club Zürich | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 26.03.2006 | FC St. Gallen | - | FC Thun | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 02.04.2006 | FC Thun | - | FC Aarau | 1:1 |  |
|||
| 28. Jornada | 06.04.2006 | FC Aarau | - | FC Thun | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 09.04.2006 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 3:1 | ||||
| 30. Jornada | 12.04.2006 | Grasshopper Club Zürich | - | FC Thun | 3:1 | ||||
| 35. Jornada | 07.05.2006 | BSC Young Boys | - | FC Thun | 2:1 | ||||
| 36. Jornada | 14.05.2006 | FC Thun | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 |
Suiza