| 2. Jornada | 16.07.2016 | Sibir Novosibirsk | - | FK Tosno | 0:1 |  |
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| 3. Jornada | 23.07.2016 | FK Tosno | - | Mordovia Saransk | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 27.07.2016 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Tosno | 1:1 | |
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| 5. Jornada | 31.07.2016 | FK Tosno | - | Fakel Voronezh | 3:1 | ||||
| 6. Jornada | 06.08.2016 | Sokol Saratov | - | FK Tosno | 1:2 | ||||
| 7. Jornada | 13.08.2016 | FK Tosno | - | Shinnik Yaroslavl | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 17.08.2016 | FK Tyumen | - | FK Tosno | 1:2 | ||||
| 9. Jornada | 21.08.2016 | FK Tosno | - | Enisey Krasnoyarsk | 1:2 | |
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| 10. Jornada | 28.08.2016 | Dinamo Moskva | - | FK Tosno | 0:1 | |
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| 25. Jornada | 08.03.2017 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Tosno | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 12.03.2017 | FK Tosno | - | FK Tyumen | 2:2 |  |
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| 27. Jornada | 19.03.2017 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Tosno | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 01.04.2017 | Baltika Kaliningrad | - | FK Tosno | 0:2 | ||||
| 30. Jornada | 08.04.2017 | FK Tosno | - | Zenit 2 | 4:1 | |
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| 31. Jornada | 12.04.2017 | Volgar Astrakhan | - | FK Tosno | 0:1 | |
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| 32. Jornada | 17.04.2017 | FK Tosno | - | Spartak Nalchik | 0:0 |
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