| 1. Jornada | 14.08.2006 | Augsburgo | - | Colonia | 0:2 |  |
|||
| 2. Jornada | 20.08.2006 | Colonia | - | Wacker Burghausen | 5:1 | ||||
| 3. Jornada | 25.08.2006 | FC Carl Zeiss Jena | - | Colonia | 3:2 | ||||
| 4. Jornada | 15.09.2006 | Colonia | - | Eintracht Braunschweig | 4:1 | ||||
| 5. Jornada | 25.09.2006 | Colonia | - | Rot-Weiss Essen | 1:0 | ||||
| 6. Jornada | 29.09.2006 | SC Paderborn 07 | - | Colonia | 2:0 | ||||
| 11. Jornada | 08.11.2006 | Colonia | - | Erzgebirge Aue | 0:1 | ||||
| 16. Jornada | 10.12.2006 | Kickers Offenbach | - | Colonia | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 15.12.2006 | Colonia | - | 1. FC Kaiserslautern | 2:2 | |
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| 18. Jornada | 21.01.2007 | Colonia | - | Augsburgo | 1:1 | ||||
| 27. Jornada | 01.04.2007 | Colonia | - | TuS Koblenz | 3:1 | |
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