| 1. Jornada | 12.08.2012 | União da Madeira | - | SC Freamunde | 2:1 |  |
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| 2. Jornada | 19.08.2012 | SC Freamunde | - | CD Tondela | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 26.08.2012 | SC Freamunde | - | Portimonense SC | 1:3 | |
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| 5. Jornada | 02.09.2012 | Leixões SC | - | SC Freamunde | 2:2 | |
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| 3. Jornada | 08.09.2012 | CD Aves | - | SC Freamunde | 0:0 |  |
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| 6. Jornada | 19.09.2012 | SC Freamunde | - | FC Penafiel | 1:3 | |
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| 8. Jornada | 30.09.2012 | SC Freamunde | - | Sporting CP B | 0:2 | ||||
| 9. Jornada | 07.10.2012 | Sporting Covilhã | - | SC Freamunde | 0:0 | |
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| 10. Jornada | 14.10.2012 | SC Freamunde | - | Atlético CP | 3:2 | ||||
| 36. Jornada | 17.04.2013 | Oporto B | - | SC Freamunde | 0:2 | ||||
| 40. Jornada | 08.05.2013 | Naval 1° de Maio | - | SC Freamunde | 2:2 | |
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