| Primera etapa | 30.07.2013 | Inti Gas | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| Segunda etapa | 28.08.2013 | Atlético Nacional | - | Guaraní | 0:0 | ||||
| Octavos de final | 27.09.2013 | Atlético Nacional | - | Bahia - BA | 1:0 | ||||
| Octavos de final | 25.10.2013 | Bahia - BA | - | Atlético Nacional | 3:4 pn. | ||||
| Cuartos de final | 31.10.2013 | São Paulo FC | - | Atlético Nacional | 3:2 | ||||
| Cuartos de final | 07.11.2013 | Atlético Nacional | - | São Paulo FC | 0:0 |
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