| Primera etapa | 19.09.2002 | PFC Litex Lovech | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| Primera etapa | 03.10.2002 | Panathinaikos | - | PFC Litex Lovech | 2:1 pró. | ||||
| Segunda etapa | 31.10.2002 | Fenerbahçe | - | Panathinaikos | 1:1 | ||||
| Segunda etapa | 14.11.2002 | Panathinaikos | - | Fenerbahçe | 4:1 |  |
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| Tercera ronda | 28.11.2002 | Slovan Liberec | - | Panathinaikos | 2:2 | ||||
| Tercera ronda | 12.12.2002 | Panathinaikos | - | Slovan Liberec | 1:0 | ||||
| Octavos de final | 20.02.2003 | Panathinaikos | - | RSC Anderlecht | 3:0 | ||||
| Octavos de final | 27.02.2003 | RSC Anderlecht | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| Cuartos de final | 13.03.2003 | Oporto | - | Panathinaikos | 0:1 |  |
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| Cuartos de final | 20.03.2003 | Panathinaikos | - | Oporto | 0:2 pró. |
Francia