| 1. Jornada | 19.03.2006 | Rubin Kazan | - | FK Rostov | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 08.04.2006 | FK Rostov | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 17.04.2006 | Dinamo Moskva | - | FK Rostov | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 06.05.2006 | FK Rostov | - | FK Saturn | 0:2 | ||||
| 14. Jornada | 05.08.2006 | Spartak Moskva | - | FK Rostov | 5:2 | ||||
| 15. Jornada | 13.08.2006 | FK Rostov | - | Lokomotiv Moskva | 1:2 | ||||
| 19. Jornada | 16.09.2006 | Torpedo Moskva | - | FK Rostov | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 23.09.2006 | FK Rostov | - | Dinamo Moskva | 2:1 | ||||
| 21. Jornada | 30.09.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Rostov | 1:6 |  |
|||
| 22. Jornada | 15.10.2006 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 21.10.2006 | FK Saturn | - | FK Rostov | 0:0 | |
|||
| 24. Jornada | 25.10.2006 | FK Rostov | - | FK Amkar Perm | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 28.10.2006 | FK Rostov | - | CSKA Moscú | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 04.11.2006 | Krylia Sovetov | - | FK Rostov | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 08.11.2006 | FK Rostov | - | Luch-Energiya Vladivostok | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 18.11.2006 | FK Rostov | - | Spartak Moskva | 3:4 | |
|||
| 30. Jornada | 26.11.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Rostov | 1:0 |
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