| 6. Jornada | 11.04.2004 | FK Amkar Perm | - | Zenit | 0:2 | ||||
| 7. Jornada | 18.04.2004 | Zenit | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 01.05.2004 | Spartak Moskva | - | Zenit | 0:3 | ||||
| 10. Jornada | 08.05.2004 | Zenit | - | Dinamo Moskva | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 19.05.2004 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 22.05.2004 | Zenit | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 03.07.2004 | FK Rostov | - | Zenit | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 10.07.2004 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Zenit | 1:3 |
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