| 1. Jornada | 21.10.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 30.10.2016 | FK Žalgiris | - | FK Atlantas | 2:0 | ||||
| 3. Jornada | 06.11.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 2:1 |  |
|||
| 4. Jornada | 20.11.2016 | FK Sūduva | - | FK Atlantas | 3:1 | |
|||
| 5. Jornada | 26.11.2016 | FC Stumbras | - | FK Atlantas | 1:1 |
Rusia