| 5. Jornada | 23.08.2003 | 1. FC Synot Stare Mesto | - | Tescoma Zlín | 0:0 |  |
|||
| 6. Jornada | 01.09.2003 | Tescoma Zlín | - | Viktoria Žižkov | 3:0 | ||||
| 7. Jornada | 13.09.2003 | SFC Opava | - | Tescoma Zlín | 2:0 | ||||
| 8. Jornada | 20.09.2003 | Tescoma Zlín | - | Chmel Blsany | 3:1 | ||||
| 11. Jornada | 18.10.2003 | Viktoria Plzeň | - | Tescoma Zlín | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 25.10.2003 | FK Jablonec 97 | - | Tescoma Zlín | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 01.11.2003 | Tescoma Zlín | - | Sparta Praga | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 08.11.2003 | FK Marila Příbram | - | Tescoma Zlín | 2:4 | ||||
| 15. Jornada | 22.11.2003 | Tescoma Zlín | - | FK Teplice | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 01.12.2003 | Tescoma Zlín | - | Sigma Olomouc | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 15.02.2004 | Dynamo České Budějovice | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||||
| 18. Jornada | 21.02.2004 | Tescoma Zlín | - | Slavia Praga | 1:2 | ||||
| 21. Jornada | 14.03.2004 | Viktoria Žižkov | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||||
| 23. Jornada | 28.03.2004 | Chmel Blsany | - | Tescoma Zlín | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 11.04.2004 | 1. FC Brno | - | Tescoma Zlín | 1:2 | |
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| 26. Jornada | 17.04.2004 | Tescoma Zlín | - | Viktoria Plzeň | 3:1 | ||||
| 29. Jornada | 08.05.2004 | Tescoma Zlín | - | FK Marila Příbram | 0:2 |
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