| 14. Jornada | 15.02.2009 | FC Locarno | - | FC Gossau | 3:4 | ||||
| 17. Jornada | 28.02.2009 | FC Lausanne-Sport | - | FC Gossau | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 08.03.2009 | FC Gossau | - | FC Lugano | 0:1 | ||||
| 20. Jornada | 20.03.2009 | FC Gossau | - | FC Stade Nyonnais | 2:3 | ||||
| 22. Jornada | 09.04.2009 | FC La Chaux-de-Fonds | - | FC Gossau | 3:1 | ||||
| 23. Jornada | 17.04.2009 | FC Gossau | - | FC Thun | 4:3 | ||||
| 24. Jornada | 22.04.2009 | FC Gossau | - | FC Schaffhausen | 1:0 |  |
|||
| 25. Jornada | 25.04.2009 | FC St. Gallen | - | FC Gossau | 4:1 | ||||
| 27. Jornada | 09.05.2009 | FC Biel/Bienne | - | FC Gossau | 4:1 | ||||
| 29. Jornada | 24.05.2009 | FC Gossau | - | FC Locarno | 0:4 | ||||
| 30. Jornada | 30.05.2009 | Servette FC | - | FC Gossau | 4:0 |
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