| 1. Jornada | 30.07.2016 | Red Star FC | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 05.08.2016 | AJ Auxerre | - | Gazélec Ajaccio | 1:2 | ||||
| 3. Jornada | 12.08.2016 | FC Bourg-Péronnas | - | AJ Auxerre | 2:4 | ||||
| 4. Jornada | 19.08.2016 | AJ Auxerre | - | Clermont Foot 63 | 0:1 | ||||
| 5. Jornada | 26.08.2016 | US Orléans | - | AJ Auxerre | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 09.09.2016 | AJ Auxerre | - | FC Sochaux | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 17.09.2016 | Stade Brestois 29 | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 30.09.2016 | Stade de Reims | - | AJ Auxerre | 3:0 | ||||
| 11. Jornada | 14.10.2016 | AJ Auxerre | - | Stade Lavallois | 2:0 | ||||
| 19. Jornada | 16.12.2016 | AJ Auxerre | - | Valenciennes FC | 1:1 | ||||
| 35. Jornada | 28.04.2017 | Nîmes Olympique | - | AJ Auxerre | 0:1 |
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