| 1. Jornada | 18.01.2009 | Deportivo Guadalajara | - | Cruz Azul | 3:3 |  |
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| 2. Jornada | 25.01.2009 | Cruz Azul | - | Atlas Guadalajara | 4:0 | ||||
| 3. Jornada | 31.01.2009 | UAG Tecos | - | Cruz Azul | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 08.02.2009 | Cruz Azul | - | UANL Tigres | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 15.02.2009 | CF Monterrey | - | Cruz Azul | 3:1 | ||||
| 6. Jornada | 19.02.2009 | Cruz Azul | - | Club San Luis | 2:2 | ||||
| 7. Jornada | 22.02.2009 | Club Necaxa | - | Cruz Azul | 2:4 | ||||
| 8. Jornada | 01.03.2009 | Cruz Azul | - | Atlante | 0:0 | ||||
| 9. Jornada | 08.03.2009 | Santos Laguna | - | Cruz Azul | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 15.03.2009 | Cruz Azul | - | CF América | 1:3 |  |
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| 12. Jornada | 05.04.2009 | Cruz Azul | - | Pumas UNAM | 2:3 | ||||
| 13. Jornada | 12.04.2009 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 19.04.2009 | Cruz Azul | - | Puebla FC | 1:2 | |
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| 17. Jornada | 10.05.2009 | Jaguares Chiapas | - | Cruz Azul | 3:3 |
Paraguay
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