| 10. Jornada | 28.08.2016 | Dinamo Moskva | - | FK Tosno | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 03.09.2016 | FK Tosno | - | Baltika Kaliningrad | 4:1 |  |
|||
| 13. Jornada | 17.09.2016 | FK Tosno | - | Volgar Astrakhan | 3:0 | ||||
| 14. Jornada | 26.09.2016 | Spartak Nalchik | - | FK Tosno | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 08.10.2016 | Spartak Moskva 2 | - | FK Tosno | 1:3 | ||||
| 18. Jornada | 22.10.2016 | FK Tosno | - | FK Tambov | 2:0 | ||||
| 19. Jornada | 30.10.2016 | SKA-Khabarovsk | - | FK Tosno | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 05.11.2016 | FK Tosno | - | Sibir Novosibirsk | 3:0 | ||||
| 21. Jornada | 09.11.2016 | Mordovia Saransk | - | FK Tosno | 0:2 | ||||
| 22. Jornada | 13.11.2016 | FK Tosno | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:0 | ||||
| 23. Jornada | 19.11.2016 | Fakel Voronezh | - | FK Tosno | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 19.03.2017 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Tosno | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 26.03.2017 | FK Tosno | - | Dinamo Moskva | 1:2 | ||||
| 35. Jornada | 06.05.2017 | FK Neftekhimik | - | FK Tosno | 0:2 | ||||
| 36. Jornada | 10.05.2017 | FK Tambov | - | FK Tosno | 3:0 |
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