| 21. Jornada | 24.01.2004 | Las Palmas | - | Rayo | 1:0 | ||||
| 22. Jornada | 01.02.2004 | Levante | - | Rayo | 3:1 |  |
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| 23. Jornada | 08.02.2004 | Rayo | - | Xerez CD | 2:1 | |
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| 24. Jornada | 14.02.2004 | Polideportivo Ejido | - | Rayo | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 21.02.2004 | Rayo | - | Terrassa FC | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 29.02.2004 | Rayo | - | Cádiz CF | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 07.03.2004 | Elche | - | Rayo | 2:1 | |
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| 29. Jornada | 21.03.2004 | Numancia | - | Rayo | 1:0 | |
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| 30. Jornada | 27.03.2004 | Rayo | - | Ciudad de Murcia | 2:0 | ||||
| 31. Jornada | 03.04.2004 | Eibar | - | Rayo | 5:0 | ||||
| 32. Jornada | 10.04.2004 | Rayo | - | Tenerife | 1:1 | ||||
| 33. Jornada | 17.04.2004 | Sporting | - | Rayo | 3:1 | |
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| 35. Jornada | 01.05.2004 | Atlético Malagueño | - | Rayo | 2:1 | ||||
| 36. Jornada | 08.05.2004 | Rayo | - | Getafe | 1:2 | ||||
| 37. Jornada | 16.05.2004 | Alavés | - | Rayo | 3:0 | ||||
| 38. Jornada | 23.05.2004 | Rayo | - | Algeciras CF | 2:2 | ||||
| 39. Jornada | 30.05.2004 | RC Recreativo | - | Rayo | 0:0 | ||||
| 40. Jornada | 06.06.2004 | Rayo | - | Córdoba | 2:0 | ||||
| 41. Jornada | 13.06.2004 | UD Salamanca | - | Rayo | 1:1 | ||||
| 42. Jornada | 19.06.2004 | Rayo | - | Las Palmas | 1:2 |
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