| Primera etapa | 23.08.2006 | Central Español | - | Nacional | 0:1 |  |
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| Primera etapa | 29.08.2006 | Nacional | - | Central Español | 0:0 | |
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| Segunda etapa | 05.09.2006 | Libertad | - | Nacional | 1:2 | ||||
| Segunda etapa | 19.09.2006 | Nacional | - | Libertad | 2:1 | |
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| Octavos de final | 28.09.2006 | Nacional | - | Boca Juniors | 2:1 | ||||
| Octavos de final | 12.10.2006 | Boca Juniors | - | Nacional | 1:3 pn. | ||||
| Cuartos de final | 19.10.2006 | Nacional | - | Athletico Paranaense | 1:2 | |
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| Cuartos de final | 25.10.2006 | Athletico Paranaense | - | Nacional | 4:1 | |
Uruguay