| 20. Jornada | 08.01.2017 | CF Villanovense | - | Extremadura UD | 0:0 | ||||
| 21. Jornada | 15.01.2017 | Extremadura UD | - | FC Jumilla | 4:0 |  |
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| 22. Jornada | 22.01.2017 | RB Linense | - | Extremadura UD | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 12.02.2017 | Extremadura UD | - | Córdoba B | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 19.02.2017 | Atlético Mancha Real | - | Extremadura UD | 1:2 | ||||
| 27. Jornada | 25.02.2017 | Extremadura UD | - | CD El Ejido 2012 | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 12.03.2017 | Extremadura UD | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 02.04.2017 | Granada B | - | Extremadura UD | 2:3 | ||||
| 33. Jornada | 09.04.2017 | Extremadura UD | - | San Fernando CD | 1:1 | ||||
| 38. Jornada | 14.05.2017 | Real Murcia | - | Extremadura UD | 3:0 |
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