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| 18.09.1999 | 16:00 | Inkaras Kaunas | - | FK Banga Gargždai | 2:0 | |
| 19.09.1999 | 14:00 | FK Kareda Siauliai | - | FK Zalgiris | 0:1 | |
| 16:00 | FK Ekranas | - | FK Nevėžis | 0:0 | ||
| 16:00 | FK Atlantas | - | Ardena Vilnius | 0:0 | ||
| 16:00 | Zalgiris Kaunas | - | FK Dainava Alytus | 2:1 |
| » Clasificación | En casa | Fuera de casa | 1.ª vuelta | 2.ª vuelta |
| # | Equipo | P | V | E | D | Goles | DG | Pun. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Zalgiris Kaunas | 11 | 9 | 1 | 1 | 22:6 | 16 | 28 |
| 2 |
|
FK Zalgiris | 11 | 6 | 3 | 2 | 20:7 | 13 | 21 |
| 3 |
|
FK Kareda Siauliai | 11 | 6 | 1 | 4 | 20:11 | 9 | 19 |
| 4 |
|
FK Ekranas | 11 | 5 | 4 | 2 | 13:8 | 5 | 19 |
| 5 |
|
FK Atlantas | 11 | 5 | 3 | 3 | 22:17 | 5 | 18 |
| 6 |
|
Inkaras Kaunas | 11 | 4 | 4 | 3 | 13:13 | 0 | 16 |
| 7 |
|
FK Nevėžis | 11 | 3 | 4 | 4 | 6:11 | -5 | 13 |
| 8 |
|
FK Banga Gargždai | 11 | 0 | 5 | 6 | 8:21 | -13 | 7 |
| 9 |
|
Ardena Vilnius | 11 | 1 | 3 | 7 | 5:16 | -11 | 5 |
| 10 |
|
FK Dainava Alytus | 11 | 1 | 2 | 8 | 6:25 | -19 | 5 |
