| 3. Jornada | 26.07.2009 | Boyacá Chicó | - | Envigado FC | 4:2 |  |
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| 4. Jornada | 02.08.2009 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 1:0 |  |
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| 5. Jornada | 09.08.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pereira | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 16.08.2009 | La Equidad | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 7. Jornada | 23.08.2009 | Boyacá Chicó | - | América de Cali | 1:1 | |
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| 8. Jornada | 30.08.2009 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 5:2 | ||||
| 9. Jornada | 13.09.2009 | Deportes Quindío | - | Boyacá Chicó | 1:3 | ||||
| 10. Jornada | 20.09.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportes Quindío | 3:1 | |
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| 11. Jornada | 27.09.2009 | Deportes Tolima | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 12. Jornada | 03.10.2009 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 2:2 | ||||
| 13. Jornada | 18.10.2009 | Cúcuta Deportivo | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 14. Jornada | 22.10.2009 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 25.10.2009 | Once Caldas | - | Boyacá Chicó | 2:2 | ||||
| 16. Jornada | 01.11.2009 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pasto | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 08.11.2009 | Deportivo Cali | - | Boyacá Chicó | 4:2 | ||||
| 18. Jornada | 15.11.2009 | Boyacá Chicó | - | Real Cartagena | 4:0 |
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