| Primera etapa | 30.01.2008 | Atlas Guadalajara | - | La Paz FC | 2:0 |  |
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| Primera etapa | 06.02.2008 | La Paz FC | - | Atlas Guadalajara | 1:0 | ||||
| Grupo 3 | 22.02.2008 | Atlas Guadalajara | - | Colo-Colo | 3:0 |  |
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| Grupo 3 | 07.03.2008 | Boca Juniors | - | Atlas Guadalajara | 3:0 | |
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| Grupo 3 | 13.03.2008 | Atlas Guadalajara | - | UA Maracaibo | 3:0 | ||||
| Grupo 3 | 26.03.2008 | UA Maracaibo | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| Grupo 3 | 09.04.2008 | Atlas Guadalajara | - | Boca Juniors | 3:1 | ||||
| Grupo 3 | 23.04.2008 | Colo-Colo | - | Atlas Guadalajara | 1:1 | ||||
| Octavos de final | 30.04.2008 | CA Lanús | - | Atlas Guadalajara | 0:1 | ||||
| Octavos de final | 07.05.2008 | Atlas Guadalajara | - | CA Lanús | 2:2 | ||||
| Cuartos de final | 15.05.2008 | Boca Juniors | - | Atlas Guadalajara | 2:2 | ||||
| Cuartos de final | 22.05.2008 | Atlas Guadalajara | - | Boca Juniors | 0:3 |
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