| 22. Jornada | 28.01.2012 | Hércules CF | - | Villarreal B | 0:2 | ||||
| 23. Jornada | 05.02.2012 | FC Cartagena | - | Hércules CF | 0:3 |  |
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| 24. Jornada | 12.02.2012 | Hércules CF | - | Deportivo | 1:4 | ||||
| 25. Jornada | 19.02.2012 | RC Recreativo | - | Hércules CF | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 24.02.2012 | Barcelona B | - | Hércules CF | 0:1 | ||||
| 27. Jornada | 03.03.2012 | Hércules CF | - | CE Sabadell | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 10.03.2012 | Alcorcón | - | Hércules CF | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 17.03.2012 | Hércules CF | - | CD Guadalajara | 5:0 |  |
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| 31. Jornada | 24.03.2012 | Hércules CF | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:3 | |
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| 32. Jornada | 01.04.2012 | Córdoba | - | Hércules CF | 3:1 | |
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| 34. Jornada | 14.04.2012 | Real Murcia | - | Hércules CF | 2:6 | |
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| 35. Jornada | 21.04.2012 | Hércules CF | - | Celta | 1:0 | ||||
| 36. Jornada | 29.04.2012 | Elche | - | Hércules CF | 0:3 | ||||
| 37. Jornada | 05.05.2012 | Hércules CF | - | Almería | 0:0 | ||||
| 38. Jornada | 13.05.2012 | Valladolid | - | Hércules CF | 1:1 | |
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| 39. Jornada | 16.05.2012 | Hércules CF | - | Numancia | 1:3 | ||||
| 30. Jornada | 23.05.2012 | CD Alcoyano | - | Hércules CF | 0:5 | |
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| 41. Jornada | 27.05.2012 | Hércules CF | - | Xerez CD | 2:2 | ||||
| 42. Jornada | 03.06.2012 | Huesca | - | Hércules CF | 1:2 |
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