| 1. Jornada | 18.01.2004 | Atlante | - | Deportivo Toluca | 0:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 25.01.2004 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 01.02.2004 | Atlante | - | Club Necaxa | 3:1 |  |
|||
| 4. Jornada | 08.02.2004 | Puebla FC | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 5. Jornada | 15.02.2004 | Atlante | - | Pumas UNAM | 2:4 | |
|||
| 6. Jornada | 22.02.2004 | Cruz Azul | - | Atlante | 1:3 | ||||
| 7. Jornada | 26.02.2004 | Atlante | - | Veracruz (old) | 3:3 | ||||
| 8. Jornada | 29.02.2004 | UAG Tecos | - | Atlante | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 07.03.2004 | Atlante | - | CF Monterrey | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 15.03.2004 | CF América | - | Atlante | 1:1 | ||||
| 11. Jornada | 21.03.2004 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 3:4 | ||||
| 12. Jornada | 28.03.2004 | Real San Luis | - | Atlante | 0:0 | ||||
| 13. Jornada | 04.04.2004 | Atlante | - | Santos Laguna | 2:1 | |
|||
| 14. Jornada | 11.04.2004 | Club Irapuato | - | Atlante | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 18.04.2004 | Jaguares Chiapas | - | Atlante | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 25.04.2004 | Atlante | - | CF Pachuca | 3:2 | ||||
| 17. Jornada | 02.05.2004 | Monarcas Morelia | - | Atlante | 0:3 | ||||
| 18. Jornada | 09.05.2004 | Atlante | - | Gallos Blancos (old) | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.05.2004 | UANL Tigres | - | Atlante | 0:2 |
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