| 17. Jornada | 20.07.2016 | Joinville - SC | - | Goiás - GO | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 30.07.2016 | Joinville - SC | - | Oeste - SP | 0:1 |  |
|||
| 19. Jornada | 03.08.2016 | Vila Nova - GO | - | Joinville - SC | 2:1 | |
|||
| 20. Jornada | 20.08.2016 | Joinville - SC | - | Luverdense - MT | 1:1 | ||||
| 21. Jornada | 27.08.2016 | Criciúma - SC | - | Joinville - SC | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 10.09.2016 | Joinville - SC | - | Tupi - MG | 1:1 | ||||
| 25. Jornada | 14.09.2016 | Joinville - SC | - | Náutico - PE | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 17.09.2016 | Vasco da Gama - RJ | - | Joinville - SC | 2:0 | ||||
| 29. Jornada | 05.10.2016 | Ceará - CE | - | Joinville - SC | 2:1 | ||||
| 30. Jornada | 08.10.2016 | Joinville - SC | - | Paysandu - PA | 0:0 | ||||
| 31. Jornada | 15.10.2016 | Joinville - SC | - | Paraná Clube | 1:0 | ||||
| 32. Jornada | 23.10.2016 | CR Brasil - AL | - | Joinville - SC | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 29.10.2016 | Joinville - SC | - | Brasil de Pelotas - RS | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 05.11.2016 | Sampaio Corrêa - MA | - | Joinville - SC | 1:2 | ||||
| 35. Jornada | 09.11.2016 | Joinville - SC | - | CA Bragantino | 1:1 | ||||
| 37. Jornada | 18.11.2016 | Oeste - SP | - | Joinville - SC | 0:2 | ||||
| 38. Jornada | 26.11.2016 | Joinville - SC | - | Vila Nova - GO | 4:2 |
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