| Grupo 2 | 08.02.2006 | Bolívar | - | Estudiantes | 1:0 | ||||
| Grupo 2 | 22.02.2006 | Estudiantes | - | Sporting Cristal | 4:3 |  |
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| Grupo 2 | 10.03.2006 | Santa Fe | - | Estudiantes | 3:1 | ||||
| Grupo 2 | 21.03.2006 | Estudiantes | - | Santa Fe | 1:0 | ||||
| Grupo 2 | 05.04.2006 | Sporting Cristal | - | Estudiantes | 2:2 | |
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| Grupo 2 | 14.04.2006 | Estudiantes | - | Bolívar | 2:1 | ||||
| Octavos de final | 26.04.2006 | Estudiantes | - | Goiás - GO | 2:0 | |
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| Octavos de final | 05.05.2006 | Goiás - GO | - | Estudiantes | 3:1 | |
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| Cuartos de final | 11.05.2006 | Estudiantes | - | São Paulo FC | 1:0 | ||||
| Cuartos de final | 20.07.2006 | São Paulo FC | - | Estudiantes | 4:3 pn. | |
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