| 3. Jornada | 12.09.2009 | AE Lárissa | - | Atromitos | 2:2 |  |
|||
| 5. Jornada | 27.09.2009 | Atromitos | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 05.10.2009 | Panionios GSS | - | Atromitos | 2:1 |  |
|||
| 7. Jornada | 18.10.2009 | Atromitos | - | Levadiakos | 3:0 | ||||
| 12. Jornada | 29.11.2009 | Atromitos | - | PAS Giannina | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 06.12.2009 | Panathinaikos | - | Atromitos | 3:1 | ||||
| 14. Jornada | 13.12.2009 | Atromitos | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 10.01.2010 | AEK Athen | - | Atromitos | 3:3 | ||||
| 21. Jornada | 07.02.2010 | Atromitos | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 28.02.2010 | Olympiacos | - | Atromitos | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 07.03.2010 | Ergotelis | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 28.03.2010 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:3 | ||||
| 29. Jornada | 11.04.2010 | Skoda Xanthi | - | Atromitos | 2:1 |
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