| Grupo 2 | 02.03.2000 | Boca Juniors | - | Universidad Católica | 2:1 | ||||
| Grupo 2 | 16.03.2000 | Peñarol | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| Grupo 2 | 22.03.2000 | Boca Juniors | - | Blooming | 6:1 | ||||
| Grupo 2 | 19.04.2000 | Boca Juniors | - | Peñarol | 3:1 |  |
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| Octavos de final | 03.05.2000 | El Nacional | - | Boca Juniors | 0:0 | ||||
| Octavos de final | 09.05.2000 | Boca Juniors | - | El Nacional | 5:3 | ||||
| Cuartos de final | 24.05.2000 | Boca Juniors | - | River Plate | 3:0 | ||||
| Semifinales | 31.05.2000 | Boca Juniors | - | CF América | 4:1 | |
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| Semifinales | 07.06.2000 | CF América | - | Boca Juniors | 3:1 |
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