| 20. Jornada | 26.08.2006 | Albirex Niigata | - | Oita Trinita | 3:3 |  |
|||
| 21. Jornada | 30.08.2006 | Gamba Osaka | - | Albirex Niigata | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 09.09.2006 | Júbilo Iwata | - | Albirex Niigata | 7:0 | ||||
| 24. Jornada | 24.09.2006 | Albirex Niigata | - | Ventforet Kofu | 3:0 | |
|||
| 25. Jornada | 30.09.2006 | FC Tokyo | - | Albirex Niigata | 1:4 | ||||
| 26. Jornada | 07.10.2006 | Albirex Niigata | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 14.10.2006 | Albirex Niigata | - | Kyoto Purple Sanga | 1:1 |  |
|||
| 28. Jornada | 21.10.2006 | Shimizu S-Pulse | - | Albirex Niigata | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 28.10.2006 | Albirex Niigata | - | Avispa Fukuoka | 0:1 | ||||
| 30. Jornada | 11.11.2006 | JEF United Chiba | - | Albirex Niigata | 1:3 | |
|||
| 31. Jornada | 19.11.2006 | Albirex Niigata | - | Cerezo Osaka | 2:2 | ||||
| 32. Jornada | 23.11.2006 | Kashima Antlers | - | Albirex Niigata | 5:1 | ||||
| 33. Jornada | 26.11.2006 | Sanfrecce Hiroshima | - | Albirex Niigata | 2:1 | ||||
| 34. Jornada | 02.12.2006 | Albirex Niigata | - | RB Omiya Ardija | 1:2 |
Japón