| 18. Jornada | 18.01.2009 | PAOK Saloniki | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 19. Jornada | 25.01.2009 | Aris Saloniki | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 01.02.2009 | PAOK Saloniki | - | Ergotelis | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 08.02.2009 | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 14.02.2009 | Levadiakos | - | PAOK Saloniki | 0:3 |  |
|||
| 23. Jornada | 21.02.2009 | PAOK Saloniki | - | Iraklis Saloniki | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 08.03.2009 | PAOK Saloniki | - | Olympiacos | 0:0 | |
|||
| 26. Jornada | 14.03.2009 | AE Lárissa | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 22.03.2009 | PAOK Saloniki | - | Thrasyvoulos Fylis | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 05.04.2009 | Asteras Tripolis | - | PAOK Saloniki | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Skoda Xanthi | - | PAOK Saloniki | 1:2 | ||||
| 30. Jornada | 26.04.2009 | PAOK Saloniki | - | Panserraikos | 4:1 |
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