| Grupo B | 24.08.2016 | Comerciantes Unidos | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Grupo B | 09.09.2016 | Universidad Técnica | - | Comerciantes Unidos | 2:2 | ||||
| Grupo B | 19.09.2016 | Comerciantes Unidos | - | Ayacucho FC | 3:1 | ||||
| Grupo B | 23.09.2016 | Universidad San Martín | - | Comerciantes Unidos | 1:1 | ||||
| Grupo B | 28.09.2016 | Comerciantes Unidos | - | Alianza Lima | 2:1 | ||||
| Grupo B | 16.10.2016 | Alianza Atlético | - | Comerciantes Unidos | 1:0 | ||||
| Grupo B | 20.10.2016 | Comerciantes Unidos | - | Sport Huancayo | 5:1 | ||||
| Grupo B | 23.10.2016 | Universitario de Deportes | - | Comerciantes Unidos | 2:0 |  |
|||
| Grupo B | 28.10.2016 | Comerciantes Unidos | - | Universidad Técnica | 1:0 | ||||
| Grupo B | 21.11.2016 | Comerciantes Unidos | - | Universidad San Martín | 5:1 |  |
|||
| Grupo B | 25.11.2016 | Alianza Lima | - | Comerciantes Unidos | 4:0 | ||||
| Grupo B | 27.11.2016 | Comerciantes Unidos | - | Alianza Atlético | 7:2 | |
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