| 10. Jornada | 26.09.2008 | FC Lustenau | - | FC Wacker Innsbruck | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 03.10.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | 1. FC RFE Vöcklabruck | 2:1 | ||||
| 12. Jornada | 18.10.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Magna Wiener Neustadt | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 28.11.2008 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Gratkorn | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 14.03.2009 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Lustenau | 3:0 | ||||
| 22. Jornada | 17.03.2009 | 1. FC RFE Vöcklabruck | - | FC Wacker Innsbruck | 0:1 |  |
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| 20. Jornada | 28.03.2009 | DSV Leoben | - | FC Wacker Innsbruck | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 17.04.2009 | FC Wacker Innsbruck | - | FC Gratkorn | 4:1 | |
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| 27. Jornada | 24.04.2009 | Austria Wien (A) | - | FC Wacker Innsbruck | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 01.05.2009 | FC Wacker Innsbruck | - | RB Salzburg (A) | 0:1 |
Austria