| 1. Jornada | 30.07.2016 | Sparta Praga | - | 1. FC Slovácko | 3:2 |  |
|||
| 2. Jornada | 06.08.2016 | 1. FC Slovácko | - | FK Dukla Praha | 2:2 | ||||
| 3. Jornada | 13.08.2016 | FK Jablonec | - | 1. FC Slovácko | 2:2 | ||||
| 4. Jornada | 20.08.2016 | 1. FC Slovácko | - | Bohemians Praha 1905 | 2:0 | ||||
| 5. Jornada | 27.08.2016 | Zbrojovka Brno | - | 1. FC Slovácko | 1:0 | |
|||
| 6. Jornada | 09.09.2016 | 1. FC Slovácko | - | FC Fastav Zlín | 1:3 | ||||
| 9. Jornada | 01.10.2016 | 1. FK Příbram | - | 1. FC Slovácko | 0:1 |  |
|||
| 11. Jornada | 22.10.2016 | Slavia Praga | - | 1. FC Slovácko | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 29.10.2016 | 1. FC Slovácko | - | FK Teplice | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 19.11.2016 | 1. FC Slovácko | - | FC Hradec Králové | 1:3 | |
|||
| 16. Jornada | 04.12.2016 | FK Dukla Praha | - | 1. FC Slovácko | 2:3 | ||||
| 22. Jornada | 01.04.2017 | Vysočina Jihlava | - | 1. FC Slovácko | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 20.05.2017 | 1. FC Slovácko | - | Slovan Liberec | 0:1 | ||||
| 30. Jornada | 27.05.2017 | 1. FC Slovácko | - | Sparta Praga | 1:1 |
República Checa