| 1. Jornada | 15.03.2009 | Spartak Moskva | - | Zenit | 1:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 22.03.2009 | Zenit | - | FK Saturn | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 05.04.2009 | FK Tom Tomsk | - | Zenit | 0:3 | ||||
| 4. Jornada | 12.04.2009 | Zenit | - | FK Amkar Perm | 0:0 | ||||
| 5. Jornada | 19.04.2009 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 25.04.2009 | Zenit | - | FK Khimki | 4:2 | ||||
| 11. Jornada | 30.05.2009 | Zenit | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 14.06.2009 | Spartak Nalchik | - | Zenit | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 25.07.2009 | Zenit | - | Rubin Kazan | 0:0 | ||||
| 16. Jornada | 02.08.2009 | FK Saturn | - | Zenit | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 26.09.2009 | Zenit | - | CSKA Moscú | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 04.10.2009 | Zenit | - | Dinamo Moskva | 2:1 | ||||
| 25. Jornada | 18.10.2009 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Zenit | 0:2 | ||||
| 27. Jornada | 31.10.2009 | FK Moskva | - | Zenit | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 08.11.2009 | Zenit | - | Terek Grozny | 2:0 | ||||
| 30. Jornada | 29.11.2009 | Zenit | - | Spartak Moskva | 2:1 |
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