| 23. Jornada | 21.02.1999 | UD Salamanca | - | Villarreal | 1:0 |  |
|||
| 25. Jornada | 07.03.1999 | Real Sociedad | - | Villarreal | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 14.03.1999 | Villarreal | - | Real Oviedo | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 21.03.1999 | Tenerife | - | Villarreal | 2:2 | ||||
| 28. Jornada | 04.04.1999 | Villarreal | - | Mallorca | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 11.04.1999 | Atlético | - | Villarreal | 2:2 | ||||
| 31. Jornada | 25.04.1999 | Alavés | - | Villarreal | 2:1 | ||||
| 32. Jornada | 02.05.1999 | Valladolid | - | Villarreal | 1:0 | |
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| 33. Jornada | 09.05.1999 | Villarreal | - | Barcelona | 2:3 | ||||
| 34. Jornada | 16.05.1999 | Athletic | - | Villarreal | 2:0 | ||||
| 35. Jornada | 23.05.1999 | Villarreal | - | Betis | 3:4 | ||||
| 37. Jornada | 13.06.1999 | Villarreal | - | Real Racing | 3:0 |
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