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| I | Universidad SC | - | Deportivo Heredia | 2:1 (1:0) | ||
| V | Deportivo Heredia | - | Universidad SC | 2:0 (1:0) | ||
| I: 05.06.2013 23:05 | V: 08.06.2013 20:00 | Campeones: Deportivo Heredia | ||||
| I | Xelaju MC | - | CSD Comunicaciones | 1:2 (0:1) | ||
| V | CSD Comunicaciones | - | Xelaju MC | 2:1 (1:1) | ||
| I: 06.06.2013 05:00 | V: 09.06.2013 02:00 | Campeones: CSD Comunicaciones | ||||
| I | Deportivo Marquense | - | Deportivo Malacateco | 2:0 (2:0) | ||
| V | Deportivo Malacateco | - | Deportivo Marquense | 3:3 (1:2) | ||
| I: 06.06.2013 20:00 | V: 09.06.2013 21:00 | Campeones: Deportivo Marquense | ||||
| I | Halcones FC | - | Deportivo Suchitepéquez | 3:1 (0:1) | ||
| V | Deportivo Suchitepéquez | - | Halcones FC | 1:1 (0:0) | ||
| I: 06.06.2013 23:15 | V: 09.06.2013 19:00 | Campeones: Halcones FC | ||||
