| 3. Jornada | 13.08.2018 | FK Ufa | - | FK Krasnodar | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 18.08.2018 | FK Krasnodar | - | Spartak Moskva | 0:1 |  |
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| 8. Jornada | 24.09.2018 | Krylia Sovetov | - | FK Krasnodar | 0:3 |  |
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| 9. Jornada | 30.09.2018 | FK Krasnodar | - | Dinamo Moskva | 3:0 | |
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| 11. Jornada | 21.10.2018 | FK Krasnodar | - | Akhmat Grozny | 0:1 |  |
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| 12. Jornada | 28.10.2018 | CSKA Moscú | - | FK Krasnodar | 1:2 | |
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| 13. Jornada | 04.11.2018 | FK Krasnodar | - | FK Rostov | 2:2 | |
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| 14. Jornada | 11.11.2018 | FK Krasnodar | - | Enisey Krasnoyarsk | 3:0 | ||||
| 15. Jornada | 25.11.2018 | FK Krasnodar | - | Arsenal Tula | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 02.12.2018 | FK Krasnodar | - | FK Ural | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 03.03.2019 | Spartak Moskva | - | FK Krasnodar | 1:1 | |
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| 19. Jornada | 11.03.2019 | FK Krasnodar | - | FK Orenburg | 2:2 | |
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| 27. Jornada | 05.05.2019 | FK Rostov | - | FK Krasnodar | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 11.05.2019 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Krasnodar | 0:4 | ||||
| 29. Jornada | 19.05.2019 | Arsenal Tula | - | FK Krasnodar | 0:3 | |
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| 30. Jornada | 26.05.2019 | FK Krasnodar | - | Rubin Kazan | 1:0 | |
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