| Grupo 1 | 14.02.2021 | Isidro Metapán | - | FAS | 2:1 | ||||
| Grupo 1 | 18.02.2021 | Isidro Metapán | - | Once Municipal | 1:1 | ||||
| Grupo 1 | 21.02.2021 | Sonsonate FC | - | Isidro Metapán | 0:3 | ||||
| Grupo 1 | 07.03.2021 | FAS | - | Isidro Metapán | 0:1 | ||||
| Grupo 1 | 09.03.2021 | Once Municipal | - | Isidro Metapán | 1:0 | ||||
| Grupo 1 | 14.03.2021 | Isidro Metapán | - | Sonsonate FC | 0:2 | ||||
| Grupo B | 20.03.2021 | CD Águila | - | Isidro Metapán | 0:2 | ||||
| Grupo B | 01.04.2021 | Isidro Metapán | - | Santa Tecla FC | 1:2 | ||||
| Grupo B | 04.04.2021 | Sonsonate FC | - | Isidro Metapán | 0:1 |  |
|||
| Grupo B | 08.04.2021 | Isidro Metapán | - | AD Chalatenango | 1:0 | ||||
| Grupo B | 11.04.2021 | Municipal Limeño | - | Isidro Metapán | 2:1 | ||||
| Grupo B | 18.04.2021 | Isidro Metapán | - | CD Águila | 1:1 | ||||
| Grupo B | 22.04.2021 | Santa Tecla FC | - | Isidro Metapán | 3:1 | |
|||
| Grupo B | 25.04.2021 | Isidro Metapán | - | Sonsonate FC | 5:2 |  |
|
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| Grupo B | 28.04.2021 | AD Chalatenango | - | Isidro Metapán | 0:4 | ||||
| Grupo B | 01.05.2021 | Isidro Metapán | - | Municipal Limeño | 2:0 | ||||
| Cuartos de final | 05.05.2021 | Luis Ángel Firpo | - | Isidro Metapán | 1:0 | ||||
| Cuartos de final | 09.05.2021 | Isidro Metapán | - | Luis Ángel Firpo | 1:3 | |
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