| 22. Jornada | 18.01.2009 | Go Ahead Eagles | - | FC Zwolle | 0:1 |  |
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| 23. Jornada | 23.01.2009 | FC Zwolle | - | AGOVV | 3:2 | |
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| 25. Jornada | 06.02.2009 | FC Zwolle | - | VVV-Venlo | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 13.02.2009 | FC Zwolle | - | RBC Roosendaal | 0:2 | |
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| 24. Jornada | 17.02.2009 | SC Cambuur | - | FC Zwolle | 1:2 |  |
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| 27. Jornada | 20.02.2009 | FC Emmen | - | FC Zwolle | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 27.02.2009 | FC Zwolle | - | BV Veendam | 3:2 | ||||
| 29. Jornada | 06.03.2009 | RKC Waalwijk | - | FC Zwolle | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 13.03.2009 | FC Zwolle | - | FC Omniworld | 3:1 | |
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| 31. Jornada | 20.03.2009 | SBV Excelsior | - | FC Zwolle | 0:2 | ||||
| 32. Jornada | 27.03.2009 | FC Zwolle | - | FC Den Bosch | 1:0 | ||||
| 33. Jornada | 03.04.2009 | Telstar | - | FC Zwolle | 0:2 | |
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| 34. Jornada | 10.04.2009 | FC Zwolle | - | TOP Oss | 0:0 | ||||
| 35. Jornada | 17.04.2009 | FC Zwolle | - | Fortuna Sittard | 2:1 | |
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| 36. Jornada | 24.04.2009 | FC Eindhoven | - | FC Zwolle | 2:0 | ||||
| 37. Jornada | 01.05.2009 | Helmond Sport | - | FC Zwolle | 0:0 | |
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