| 11. Jornada | 29.10.2016 | Marbella FC | - | San Fernando CD | 2:3 | ||||
| 16. Jornada | 27.11.2016 | San Fernando CD | - | FC Jumilla | 1:0 | ||||
| 17. Jornada | 04.12.2016 | RB Linense | - | San Fernando CD | 0:2 | ||||
| 20. Jornada | 08.01.2017 | Córdoba B | - | San Fernando CD | 0:1 | ||||
| 22. Jornada | 22.01.2017 | CD El Ejido 2012 | - | San Fernando CD | 4:0 | ||||
| 27. Jornada | 26.02.2017 | San Fernando CD | - | Granada B | 2:2 |  |
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| 28. Jornada | 05.03.2017 | San Fernando CD | - | Real Murcia | 3:1 | ||||
| 33. Jornada | 09.04.2017 | Extremadura UD | - | San Fernando CD | 1:1 | |
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| 38. Jornada | 14.05.2017 | San Fernando CD | - | Linares Deportivo | 4:1 |
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