| 22. Jornada | 04.02.2024 | Antequera CF | - | Mérida AD | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 11.02.2024 | Real Madrid Castilla | - | Mérida AD | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 17.02.2024 | Mérida AD | - | CD Castellón | 2:1 |  |
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| 25. Jornada | 25.02.2024 | UD Ibiza | - | Mérida AD | 0:0 |  |
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| 26. Jornada | 03.03.2024 | Mérida AD | - | Atlético Baleares | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 10.03.2024 | San Fernando CD | - | Mérida AD | 0:1 | ||||
| 28. Jornada | 16.03.2024 | Mérida AD | - | CD Alcoyano | 1:3 | ||||
| 29. Jornada | 24.03.2024 | RC Recreativo | - | Mérida AD | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 30.03.2024 | Mérida AD | - | Córdoba | 2:2 | |
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| 31. Jornada | 07.04.2024 | Granada B | - | Mérida AD | 0:2 | ||||
| 32. Jornada | 13.04.2024 | Mérida AD | - | Algeciras CF | 3:1 | ||||
| 33. Jornada | 21.04.2024 | UD Melilla | - | Mérida AD | 2:0 | ||||
| 34. Jornada | 28.04.2024 | Mérida AD | - | Atlético Sanluqueño CF | 0:0 | |
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| 35. Jornada | 05.05.2024 | Málaga | - | Mérida AD | 1:1 | ||||
| 36. Jornada | 11.05.2024 | Mérida AD | - | CF Intercity | 3:0 | ||||
| 37. Jornada | 18.05.2024 | Real Murcia | - | Mérida AD | 1:1 |
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